Sağlık Bakanlığı’nın 01.07.2003 tarihinde başlattığı ve 2003 Aralık ayında bir kitapçıkla kamuoyuna duyurduğu Sağlıkta Dönüşüm Programı, geçmişte yapılan reform ve proje çalışmalarını değerlendirerek gelecekte geçilmesi düşünülen sağlık sistemini tasarlayarak bu sisteme geçişi kolaylaştıracak gerekli değişiklikleri yapmak üzere; sağlık hizmetlerinin etkili, verimli ve hakkaniyete uygun şekilde organize edilmesi, finansmanının sağlanması ve hizmetin sunulmasını hedeflemektedir. Sağlıkta Dönüşüm Programınına Destek Projesi Bakanlığımız ile Dünya Bankası arasında, 4737-TU nolu ikraz anlaşması ile 11.06.2004 tarihinde imzalanmıştır. 

 Sağlıkta Dönüşüm Programının bileşenlerinin tüm ülke çapında etkin bir biçimde uygulanması amacıyla hazırlanan Sağlıkta Dönüşüm Programınına Destek Projesi’nin A4 bileşeninin uygulanmasından sorumlu birim olarak 15.08.2005 tarih, 985 sayılı Makam Onayı ile “İzleme ve Değerlendirme Birimi” kurulmuştur.  

Ocak 2006 itibariyle 5 Saha Koordinatörü ve 1 Baş Saha Koordinatörü göreve başlamıştır. İzleme ve Değerlendirme Birimi Saha Koordinatörlüğü uygulaması, 2006/17 sayılı Genelge ile tüm taşra ve merkez teşkilatına duyurulmuştur. 

Saha Koordinatörleri Sağlıkta Dönüşüm Programı’nın ülke çapında etkin bir şekilde uygulanmasını sağlamak üzere sorumluluk bölgelerindeki illerin farklı sahalarında çalışarak; proje kapsamında önemli ve temel uygulamaların izlenmesi ve değerlendirilmesi amacıyla il gezileri yapmaktadırlar. İl gezilerinde; İl Sağlık Müdürlükleri, sağlık kuruluşları ve yöneticileri ile birlikte gezilerek; yöneticilere SDP’ı anlatılmakta, uygulamalar değerlendirmekte ve geribildirimler alınmaktadır. 

Yapılan il değerlendirmeleri sonucunda İl Sağlık Müdürlükleri bünyesinde, istatistik ve bilgi işlem şube müdürlüklerince yapılması gereken çalışmaların diğer şubeler ile merkez teşkilatı arasında daha etkin koordinasyonunu sağlayacak bir yapılanmaya ihtiyaç duyulduğu tespit edilmiştir. Bu amaçla İzleme ve Değerlendirme Birimi’nin 02 / 05 /2006 tarih ve 2006/ 53 sayılı Genelge’ si ile İl Sağlık Müdürlükleri bünyesinde İl Veri Temsilcilikleri kurulmuştur. Genelgeye göre; Bilgi işlemden sorumlu Müdür Yardımcısı İl Veri Temsilcisi olarak görevlendirilecek ve veri güvenliği değerlendirmesi ile verilere dayalı planlama ve hedeflerin oluşturulması çalışmalarına başkanlık yapacaktır. Aynı zamanda izleme ve değerlendirmeye yönelik hedefleri oluşturmak üzere tüm birimleri koordine edecektir.

 2006 Temmuz-Ağustos-Eylül aylarında Saha Koordinatörleri tarafından Bakan Bey’in bizzat katılımı ile gerçekleşen yaklaşık 35 ilin değerlendirmesi yapılmıştır. 3 Kasım 2006 tarihinden itibaren Saha Koordinatörü sayısı 14+1’e çıkmıştır.  

Proje Yönetim Destek Birimi’nin 14.03.2007 tarih ve 13 sayılı Bakanlık oluru ile, “Sağlıkta Geçiş Projesi’ne Uygulama Desteği”nin Maliyet Paylaşımı Anlaşması ile ilgili olarak İzleme ve Değerlendirme Birimi 01.01.2007 tarihi itibariyle yetkili ve görevli kılınmıştır ve Birimin adı 20.03.2007 tarih ve 236 sayılı Bakanlık oluru ile “İzleme ve Değerlendirme Koordinatörlüğü” olarak değiştirilmiştir.   

İzleme ve Değerlendirme Koordinatörlüğü’ne 2007 yılı Bakanlık bütçesinden bir bütçe tahsis edilmiş ve Birimin Koordinatörü ya da Koordinatör adına vekalet edecek bir kişiye, İdari ve Mali İşler Dairesi Başkanlığı’nın 04.04.2007 tarih ve 2203 sayılı yazısı ile harcama yetkisi verilmiştir. 

11 Temmuz 2007’de Dünya Bankası ile kredi anlaşması revizyonu gerçekleştirilmiş ve sorumlusu olduğumuz A4 alt bileşeni, “Sağlık Reformu Uygulaması ve İzleme ve Değerlendirme Kapasitesinin Kurulması” olarak değiştirilmiştir. Bu bileşen sağlık reformu uygulamasında SB izleme ve değerlendirme kapasitesi oluşumunun desteklenmesi, program izleme verilerinin düzenli olarak toplanması ve analizi ve bu bilgilerin Program uygulamasının iyileştirilmesi için kullanılmasını sağlayacaktır. Yerel danışmanlar, uluslararası teknik yardım ve eğitimler vasıtasıyla, düzenli program izlenmesinden elde edilen verileri “Yıllık Sektör Performans Raporu” ve programın uygulanmasıyla ilgili diğer küçük değerlendirmelerin üretilmesinde kullanacaktır.  

26–30 Kasım 2007 tarihleri arasında taşra ve merkez teşkilatından olmak üzere toplam 125 kişinin katılımı ile Ankara’da “İzleme ve Değerlendirme Denetçi Eğitimi” gerçekleştirilmiştir.  

1 Temmuz 2008 tarihinden itibaren Saha Koordinatörü sayısı 22+1’e çıkmıştır. 2009 Ocak ayında Saha Koordinatörlüğü uygulaması hakkında yeni bir Genelge yayınlanmıştır. 

İzleme ve Değerlendirme Koordinatörlüğü bünyesinde halen 10 geçici görevlendirilmiş Bakanlık personeli görev yapmaktadır. Diğer yandan Koordinatörlük bünyesinde, 15 Kasım 2006 tarihinde “İstatistik Uzmanı” istihdam edilmiştir. 4 Temmuz 2008 tarihine kadar sözleşmesi yenilenerek görevine devam etmiştir.  

13 Aralık 2006 tarihinde “İzleme ve Değerlendirme Asistanı” istihdam edilmiştir.