Proje Yönetim Destek Birimi, 24 Mart 2004 yılında -makam oluru ile- Sağlıkta dönüşüm projesinin yürütülmesine yardımcı olmak üzere kurulmuştur. Önceden mevcut olan Sağlık Projesi Genel Koordinatörlüğünün fiziksel ve insan kaynakları bu tarihten itibaren Proje Yönetim Destek Birimi olarak varlığını ve faaliyetlerini sürdürmüştür.